El Dr. Neo Cortex planea apoderarse del mundo, y para conseguirlo quiere crear animales modificados genéticamente. Para forma a sus súbditos, Cortex rapto a cuantos animales se pudo, y la novia de Crash Bandicoot resulta ser una de las víctimas. Toma el control de Crash mientras corre, salta y gira a lo largo de 30 niveles de intensa acciónen tres islas australianas diferentes. Sólo tú puedes ayudar a Crash a frustrar los planes de Dr. Cortex y rescatar a su novia y a los animales.